鹿児島県の奄美地方と沖縄県の沖縄本島北部では8日夜から9日明け方にかけ、暖かく湿った空気が流れ込んで大雨となった。気象庁は9日午前2時40分に鹿児島県与論町(与論島)に大雨特別警報を発表し、直ちに安全を確保するよう呼び掛けた。沖縄県大宜味村の一部には一時、5段階の警戒レベルで最も高い「緊急安全確保」が発令された。
奄美地方と沖縄本島北部では発達した雨雲が連なる線状降水帯が発生し、1時間雨量が110〜120ミリとの記録的短時間大雨情報が相次いで出された。与論町では8日午前から雨が降っており、9日午前7時20分までの24時間雨量が観測史上最多の590.5ミリに上った。土砂災害や低地の浸水、河川の増水に最大級の警戒が必要という。
日本列島が高気圧に覆われる一方、フィリピンの東海上に低気圧、西海上に台風22号があり、奄美地方や沖縄本島北部には東や南東から暖かく湿った空気が流れ込んだ。
気象庁の杉本悟史予報課長は記者会見で、「11月に大雨特別警報を発表するのは初めてだが、南西諸島ではこの季節でも暖かく湿った空気が海上にある」と説明した。海面水温が平年より高いことも影響したと推測できるという。